疾病管制署5月15日公布國內2例日本腦炎確定病例，分別為70多歲女性和60多歲男性，共同症狀為發燒、意識改變等，經疫情調查發現兩案住家附近均有鴿舍、豬舍及水田等高風險場所，且皆查無日本腦炎疫苗接種紀錄，研判於居住地附近感染可能性較高。
感染日本腦炎者大多無明顯症狀，少數可能出現急性神經症狀，如發燒、頭痛、無菌性腦膜炎，嚴重者可能出現精神症狀（譫妄、意識不清）、腦神經功能損傷等，甚至昏迷或死亡。
國內傳播日本腦炎病媒蚊主要為三斑家蚊、環蚊家蚊和白頭家蚊，日本腦炎病媒蚊主要孳生於水稻田、池塘及灌溉溝渠等處，吸血高峰為黃昏與黎明時段，而豬為病毒的主要增幅宿主。
時序進入日本腦炎流行期，南市因應近期鄰近縣市日本腦炎疫情，呼籲豬隻養殖業者應於豬舍懸掛捕蚊燈，降低病媒蚊數量；另接種疫苗是預防日本腦炎最有效的方法，尚未完成疫苗接種之適齡嬰幼兒，請照顧者儘速帶嬰幼兒前往轄區衛生所或指定醫療機構完成接種；成人若居住地或工作場所接近豬舍、其他動物畜舍或三斑家蚊孳生地點如水稻田等高風險地區，或至流行地區旅遊，可自費接種日本腦炎疫苗。
臺灣每年5至10月為日本腦炎流行季，其中6至7月為流行高峰，2020至2023年全國同期確定病例數分別為0、2、0及2例，以40歲以上成人較多，但各年齡層都有感染風險。
日本腦炎目前尚無治療藥物，疫苗接種是最有效的預防方法；目前本市於各區衛生所和合約醫療院所，整年均有提供日本腦炎疫苗接種，年滿15個月的幼兒，應接種第1劑，間隔12個月再接種第2劑；成人若居住或工作場所鄰近豬舍、其他動物畜舍、病媒蚊孳生地點、旅遊民眾或有感染之虞的成人，其未曾接種或接種史不明者，亦可至本市旅遊醫學門診或診所(名單詳見臺南市政府衛生局網站疫苗接種專區)，經醫師評估建議自費接種。